首先用水槽刷把水槽内壁刷一遍，如果有不能刷的藻，可以用刮藻刀去除。 然后，可以取出造景石、沉木、水草，用刷子和刮藻刀去除表面的藻类。 当然，如果用这种方法去除不了表面的藻类，在造景石上沾10%的漂白剂浸泡15分钟，然后可以好好冲洗自然，用洗碗机清洗底砂，把水槽的外壁、灯、盖擦干净。 鱼缸清洗过程中，不使用肥皂和洗涤剂等是非常需要注意的问题。 否则，少量的化学物质会对鱼产生很大的影响。 另外，不能使用平时的家务工具。
要更换水，请关闭加热器、泵和过滤器，然后从水箱中取出所有装饰品和植物。 在干净的水里洗所有的东西，把它们放在一边。 请保持清洁，以免捞到鱼。 因为会给鱼带来压力，很可能会生病。必要时，用网轻轻地捞起鱼，放入装有原水槽的大玻璃杯或水桶中。彻底清洗水槽很麻烦。 不仅要打扫缸底、过滤管道、过滤仓库，干净后还要用鱼管家的杀菌水杀毒。
清理鱼缸后千万不要过度换水，不要一次性全部换完或超过一半的水，很多朋友会发现换完水几天后鱼儿全部死亡或是水会变得雾蒙蒙的，这是因为换水太多破坏了水的生态平衡，缸内溶氧量降低，鱼儿可能会被憋死。 另外，水槽的大扫除也请不要与滤材的清洗同时进行。 由于清洗过程中附着在造景素材上的硝化细菌会丢失，此时鱼缸清洗滤材会破坏水槽的硝化系统。
